Obszary Natura 2000 w granicach poligonu
W granicach Centralnego Poligonu Sił Powietrznych oraz w jego pobliżu znajdują się trzy obszary objęte ochroną w ramach programu Natura 2000.
Przymorskie Błota PLH220024
Obszar obejmuje fragment równiny błot przymorskich na zachód od Ustki wraz z jeziorem Modła. Dominującym zbiorowiskiem roślinnym są dobrze zachowane szuwary trzcinowe i turzycowe, które zarastają eutroficzne jezioro Modła.
W zachodniej części obszaru występują bardzo dobrze zachowane torfowiska wysokie i przejściowe oraz płaty borów i brzezin bagiennych, a także zarośli woskownicy europejskiej Myrica gale. Bardzo dobrze są zachowane wartościowe zbiorowiska torfowiskowe i szuwarowe oraz zarośla woskownicy europejskiej. Bogata jest tu flora roślin naczyniowych, z rzadkimi i zagrożonymi gatunkami. Obszar ma także duże znaczenie dla ochrony ptaków.
Jezioro Wicko i Modelskie Wydmy PLH320068
Obszar obejmuje bardzo dobrze wykształcone i zachowane nadmorskie wydmy białe i inicjalne stadia nadmorskich wydm białych - porównywalne ze Słowińskim Parkiem Narodowym, oraz najlepiej w województwie zachodniopomorskim zachowane płaty nadmorskich borów bażynowych. W obszarze znajduje się także duże eutroficzne jezioro przymorskie – Wicko.
Jezioro Wicko jest dużym (1 050 ha) jeziorem przymorskim, oddzielonym od morza piaszczystą mierzeją. Maksymalna głębokość wynosi 6 m; dno jeziora stanowi kryptodepresję. Jezioro Wicko jest bardzo dobrze zachowanym jeziorem przymorskim (siedlisko przyrodnicze 1150). Jego brzegi zachowały się w większości w naturalnym stanie i nie są zurbanizowane.
Do najważniejszych przedmiotów ochrony należą:
Inicjalne stadia nadmorskich wydm białych (2110)
Nadmorskie wydmy białe (Elymo-Ammophiletum), (2120)
Fot. 2. Masowo występująca piaskownica zwyczajna obserwowana na wydmie białej, wraz z licznym udziałem gatunku chronionego - mikołajka nadmorskiego Eryngium maritimum (fot. J. Pranga)
Pewne fragmenty wydm białych (także wydm szarych) występujących na omawianym obszarze charakteryzują się znacznym udziałem gatunków chronionych: mikołajka nadmorskiego Eryngium maritimum (fot. 2) oraz kruszczyka rdzawoczerwonego Epipactis atrorubens (fot. 3 i 4).
Fot. 3 i 4. Kruszczyk rdzawoczerwony Epipactis atrorubens- liczna populacja występująca na wydmach w granicach poligonu (fot. J. Pranga)
Przybrzeżne Wody Bałtyku PLB990002
Obejmuje wody przybrzeżne Bałtyku o głębokości od 0 do 20 m. Jej granice rozciągają się na odcinku 200 km, poczynając od nasady Półwyspu Helskiego, a na Zatoce Pomorskiej kończąc. Dno morskie jest nierówne, deniwelacje sięgają 3 m.
Ostoja ptasia o randze europejskiej E 80. Na obszarze zimują w znaczących ilościach 2 gatunki ptaków z Załącznika I Dyrektywy Rady 79/409/EWG: nur czarnoszyi Gavia arctica i nur rdzawoszyi G. stellata (C7). W okresie zimy występuje powyżej 1% populacji szlaku wędrówkowego (C3) lodówki Clangula hyemalis, co najmniej 1% nurnika Cepphus grylle i uhli Melanitta fusca. W faunie bentosowej dominują drobne skorupiaki. Rzadko obserwowane są duże ssaki morskie - foki szare Phoca hispida i obrączkowane Halichoerus grypus oraz morświny Phocaena phocaena.